根據Vista測試用戶表示，最終版本的Vista與Windows Live Messenger不相容，每天最高可衝突20次，此外，Microsoft自己所推出的數位音樂播放器Zune，也無法相容Vista作業系統。
先前Microsoft測試報告便指出Vista測試版與Windows Live Messenger 8.0正式版和8.1測試版之間相互衝突，以為此問題可以在Vista正式版中獲得解決。不過依據多名Vista正式版測試用戶的回饋意見中顯示，此類問題仍未得到完滿解決。測試者有的表示，Windows Live Messenger在Vista上運作3個小時之後，就開始不斷衝突，有時連續衝突4次。有的測試者表示，儘管Windows Live Messenger 8.0比8.1穩定，但還是與Vista不相容，就好像新版播放器WMP 11一般。且Windows Live Messenger 8.0每天可能只衝突1次，但8.1每天可以衝突到10-20次。相比之下，AIM 6.0測試版在Vista上運作平順。
Microsoft並不否認Windows Live Messenger 8.1與Vista的問題仍有改善進步的空間，並且表示該問題將在8.1正式版中完全解決。
至於Vista與Zune播放器之間的衝突問題，Microsoft比較輕鬆地認為，使用者只需等待往後的更新程式即可。不過Microsoft的發言人已經表示，支援Vista作業系統的全新Zune播放器，因此將無法在明年2007年1月底之前上市，這意味著Zune將無法搭上Vista消費者版本作業系統的順風車熱銷狂賣。
甚者，目前Zune並不能相容Microsoft旗下的MSN音樂商店。
